計畫目標

生物資訊中心 (Bioinformatics Center)

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計畫目標

背景資料

	廣義的基因體研究
	基因體分析現況

設立緣由

生物資訊之特點是它的量大，而且有用的資料是隱藏在許多雜訊之中。要如何管理與分析這大量的資訊，以加速生物與醫學研究，是後基因體世代（post-genomic era）的重要課題。如何由序列資訊中開發寶藏將是未來生技產業的決勝點，此外，未來的生物學可能會是先用序列分析評估策略，再設計實驗解決問題。國內各界已體會到生物技術將是21世紀的重要產業，而歐美各大藥廠與研究機構，爭相聘用生物資訊人才的趨勢來看，生物資訊乃是目前生物科技中非常重要而且欠缺的一環。

目前國內發展生物資訊的困境有兩個，第一是缺乏適當規模的工作團隊，第二是缺少計算資源。在沒有良好團隊的狀況下，沒有人敢增加計算資源，因為硬體進步太快，若不使用則會很快折價。可是沒有足夠的計算資源時，只能針對某一問題作個案的研究，無法由整體的角度來思考問題。例如我們可以一次研究一個疾病，也可以同時找到多個值得研究的疾病，再尋找最適合切入的病。由專業的角度看，某一疾病的專家當然能夠針對自己熟悉的疾病做深入的研究。可是對國家科技發展，或一個擁有許多不同專家的醫學中心而言，若能先知道一些容易研究的病，再找適當的專家合作來做，顯然更有效率。在生物資訊學的研究上，每次做分析時必須思考怎麼做，會打斷原有之思緒。若能一次計算出所有需要的資訊，存入資料庫，再在思考問題時查閱資料庫，將比每次需要資訊時再做計算有效率。因此建立核心實驗室，將資源作重點投資，能使生物資訊之發展跳脫惡性循環，產生催化生物科技發展之功能。

具體目標

國家高速電腦中心與國家衛生院已提供部份生物資訊學之服務，但此二機構所顧及的是全面性的服務，對追求卓越的目標而言仍有不足。為補強在專業研究上之需求，追求卓越計畫將扮演關鍵性的角色。此計畫雖然無法提供所有的需求，卻已解決了上述兩大困境之一，也就是計算資源的問題。在此基礎上，本核心實驗室將致力於以下三個方向，使本校基因體學之研究進入一良性循環:

與定序、基因表現、和蛋白質分析等三個核心實驗室密切合作，推動下游的研究 (階段性目標)

沒有生物資訊學，定序、基因表現、和蛋白質分析等三個核心實驗室的結果就無法應用，也無法發揮推動功能基因體學、比較基因體學、與結構基因體學研究的目的。對肝臟與老化的研究計畫而言，這三個核心實驗室應提供整體的服務，也就是取得的結果應是加值的資訊，而非序列或數值等原始數據。因此由研究計畫委託給定序、基因表現、和蛋白質分析等三個核心實驗室之服務，將由生物資訊核心實驗室分析後才回到各研究計畫。

積極支援生物資訊學程，培訓人才

研究計畫所提供的人力，並非生物資訊之專業人才，其發展亦有極限。而學程則是有系統的培訓生物資訊之專業，這些人才對追求卓越的目標有協力促進的正面意義

積極爭取研究計畫，加強全校性服務

追求卓越計畫所提供的計算資源與人力，雖不足以建立生物資訊的專業服務，卻有助於透過研究計畫爭取人力。在建立專業服務的過程中產生的副產物，全校均可共享。只要核心實驗室有穩定的設備，校園中任何人均可用個人電腦連線使用累積的資訊。具體作法如下:

	使研究的人力，成為服務的動力追求卓越計畫所提供的人力，將用於維護系統之穩定。因此需要利用執行計畫的人力，建立資料庫與發展方法，才有辦法提供專業服務。而強大的計算資源，與穩定之系統亦有助於計畫的執行。研究與服務相輔相成，最有利於提高服務品質。
	使研究的準備工作，成為服務的內容為加速研究之效率，將建立鏡相站(例如酵母菌與小鼠研究資源)、一般資料庫(例如UniGene)、與加值資料庫(例如重複序列資料庫)，這些資料庫對校園中的各種研究都有幫助。
	使研究成果，成為服務的內容例如為尋找新的基因或致病基因而發展的方法，有助於註解定序核心實驗室產生之序列。為整合基因體、EST、蛋白質等序列資訊而發展的方法，有助於分析基因表現(微陣列)核心實驗室產生之數據

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