生物資訊實務課程的目的是讓同學建立實務的經驗，使同學在畢業後有能力自行建立或維護一個系統。這對學士級與碩士級的人才而言是非常重要的訓練，因為他們是在未來數年內產業界最需要的人才，畢業後應有能力達到產業界對他們的期望。一個良好的實習場所，就像醫學院的同學需要去好的醫學中心實習那樣重要。這些實際的經驗對同學而言都是非常寶貴的，因為許多空有生物或資訊領域的良好訓練，卻無用武之地，最主要的困擾就是沒有人告訴他們該如何用資訊的工具來解決生物學的問題，因此不得其門而入。
符合下列目標之一
系統與網路管理 (網路設定、備份、統計報表製作)。
熟悉系統指令 (mirror site管理、軟體安裝、…等)。
熟悉資料庫管理。
生物資訊諮詢或教學。
其他與生物資訊相關項目。
實習單位
一般是以國內實習為主，外文與生物資訊學水準通過學程之審核標準者，可以申請到國外單位實習。
時程
1. 為讓同學有一定之程度，而且又能在兩年內完成畢業要求，建議同學在一年升二年級的暑假實施，時間為六到八週(至少六週）。其中四週必須在暑假完成，可於兩個實習單位實習，或是在開學後分週完成不足的時間，成績登錄在次學期。
2. 每學年第二學期開學時提出申請，第四週之前確定(即與合作單位完成協調工作)，並於第六週之前公告結果於學程網頁。
3. 欲至國外單位實習者，應在遞申請書後兩週內完成審核手續。學程應協助考試合格者申請國外實習單位，並於第十二週之前完成協調工作。
申請
1. 參考學程網頁上推薦之實習單位簡介。
2. 填寫實習申請表(參閱附件一) 。
審核
1. 由負責教師協調，確定到各單位實習的學生數不超過該單位能負荷之人數。
2. 欲至國外單位實習者，測驗項目為生物資訊領域之外文溝通能力。
學習評量
1. 在實習開始時，由本學程寄送各協助實習的單位一份「生物資訊學實務」課程實施辦法及評分表 (格式參見附件二)。
2. 實習結束後，提醒各協助實習單位，依據其實習報告評分最晚應於實習結束後一月內收集所有成績。
3. 學生應製作實習報告網頁一份 ，並印出書面報告一份(格式參見附件三)供學程老師評分。