檔案「pepla.dna」是根據密碼使用頻率所寫出最可能的“一個”序列。像 Asn 有 94﹪的機會使用 AAC 當然可以接受,可是像 Phe 只有 76﹪的機會使用 UCC,另有 24﹪的機會使用 UUU。因此若想找到所有相關的序列,最好在密碼的第三個位置同時使用 U 和 C,因為這兩個核甘酸都是 pyrimidine,因此可用縮寫Y取代(參考 IUB 縮寫符號)。在最混雜的序列「pep1b.dna」中,相對應的密碼即被評為 TT“Y”。
練習 請先利用選項 c 與 d,反轉譯 pep2.pro 為 DNA 序列,以比較它們的輸出格式與選項 a. b 的差異。
Answers: 不列出密碼使用頻率的資訊
pep2c.dna
Length: 21 Jan. 10, 1997 14:39 Type: N Check: 6593 .. 1 UGCCACUUCG AAAACUGCGG U ! most probable |
pep2d.dna
Length: 21 Jan. 10, 1997 14:37 Type: N Check: 7740 .. 1 TGYCAYTTYG ARAAYTGYGG N ! most ambiguous |
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Last updated on 11/27/01