參數設定: Blast

一個使用 Blast 的技巧是將低複雜性的序列過濾掉,例如重覆序列或 gln 較多的區域等。Blast 所根據的統計理論,假設胺基酸或核甘酸出現在給定位置的機率是正比於資料庫的胺基酸或核甘酸組成。這些低複雜性的序列,不能滿足此前提,所以必須去除後才能防止程式找到許多這種片段。在 Blast 程式中提供 x-filter 可將短的重覆序列改為 X,也提供 s-filter 將低複雜性的序列改為 X,這樣在比對時需求指令行加入-filter=xs,即可同時啟動這兩個濾器。

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Last updated on 11/23/01