在 EMBOSS 環境下寫模組樣式(pattern) 的規則

1. 胺基酸用一個字母的標準代碼(one-letter code) 表示。
2. X 是代表任意的胺基酸。
3. 胺基酸後若有小括號，則代表此胺基酸重覆的次數。一般而言，小括號中有兩個數字以逗點隔開，以表示一個範圍的起點與終點，例如 CX(2，4)表示在 Cys 後有 2 至 4 個任意的胺基酸。若小括號中只有一個數字，則表示重複的次數。
4. 胺基酸若出現在中括號裡，如[ALT]則代表為Ala 或 Leu 或 Thr。
5. 胺基酸若出現在大括號裡，如{AM}則代表為除了 Ala 及 Met 以外的胺基酸。
6. 若想表示模組樣式出現在N- 或 C-terminal ，則分別以 `<' 以及 `>' 代表之。

以 [DE](2)HS{P}X(2)PX(2,4)C 為例，寫出的模組樣式表示在兩個 Asps 或 Glus 後是 His 以及 Ser，然後再接一個非 Pro 的胺基酸；一個 Pro 緊接在兩個任意胺基酸後；最後是在二到四個任意胺基酸後接著一個 Cys。

Last updated on 11/25/01