SeqWeb 程式的選用

  • 程式的種類
  • 選用的方式(參閱右圖)
    • Contents
    • Index
  • 功能增強的程式
    • Compare
    • GrowTree
    • MFold
    • ProfileSearch
    • PeptideStructure
    • StemLoop
  • 適合在 SeqWeb 上跑的程式
    • LookUp (結果有建超連結)
    • Blast (結果有建超連結)
    • Compare (圖形顯示)
    • StemLoop (圖形顯示)
    • Protein analysis (圖形顯示)
    • Prime (反覆操作時,較 UNIX 版方便)
  • 不易尋找的程式
    • LookUp (Database searching - Reference searching)
  • 耗時,不易有結果的程式 (最好在背景跑)
    • FastA / TFastA
    • FindPatterns
    • MFold (fragment > 500 bases)
    • PileUp (long seq. or multiple sequences)
    • GrowTree (long seq. or multiple sequences)
    • ProfileSearch (long seq. or multiple sequences)
  • 功能減弱的程式
    • Map (cannot specify a local data file)
    • Frames (cannot specify a local data file)
    • PeptideSort (do not calc. the properties of the full length protein
 
       

 

 

Last updated on 11/23/01